RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 PHACTR2O75167 634 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 TMEM67Q5HYA8 995 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 HDXQ7Z353 690 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 MEIS3Q99687 375 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 IFNKQ9P0W0 207 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 HAND2P61296 217 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 PIK3R4Q99570 1358 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 MYO1BO43795 1136 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.65□□□□□ -0.54
TTL-201ENST00000233336 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.65□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 A0A087WZG4 1122 aa11.65□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ERO1AQ96HE7 468 aa11.65□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.65□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 KARSQ15046 597 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RAB34Q9BZG1 259 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC160A6NGH7 325 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ZEB2O60315 1214 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 FAM83GA6ND36 823 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ZNF445P59923 1031 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 TRIM47Q96LD4 638 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.64□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 NME9Q86XW9 330 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 HOOK3Q86VS8 718 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 AFMP43652 599 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 IQCA1Q86XH1 822 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 USP26Q9BXU7 913 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 AKR1B10O60218 316 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 STRN4Q9NRL3 753 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 EVCP57679 992 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 TNNQ9UQP3 1299 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.63□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 BRF1Q92994 677 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 NLRP5P59047 1200 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 SEPT6Q14141 434 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 Q6ZUG5 572 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GUA9 196 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC6Q16204 474 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CEP83Q9Y592 693 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 MAP3K12Q12852 859 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ELF2Q15723 593 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 RMND1Q9NWS8 449 aa11.62□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 IFT140Q96RY7 1462 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 EXOC1Q9NV70 894 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 AK2P54819 239 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 DAAM2Q86T65 1068 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 UBA7P41226 1012 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 BANK1Q8NDB2 785 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 NCOA7Q8NI08 942 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CALML4Q96GE6 196 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 DESP17661 470 aa11.61□□□□□ -0.55
TTL-201ENST00000233336 CCDC114Q96M63 670 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms