RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 ERFEQ4G0M1 354 aa22.28■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 SASH1O94885 1247 aa22.27■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.27■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.27■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 GREM2Q9H772 168 aa22.27■■□□□ 1.16
CBX1-201ENST00000225603 BAG6P46379 1132 aa22.26■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.26■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.26■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.25■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.25■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.25■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.24■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.24■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 ABCC12Q96J65 1359 aa22.24■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 ITGA6P23229 1130 aa22.23■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 TM4SF1P30408 202 aa22.23■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 SLC15A2Q16348 729 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 LRRC24Q50LG9 513 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 NYXQ9GZU5 481 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 MYH3P11055 1940 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.22■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.21■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.21■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.21■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.21■■□□□ 1.15
CBX1-201ENST00000225603 EYA2O00167 538 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 DDR1Q08345 913 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 TFCP2Q12800 502 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.2■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.19■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 STK32BQ9NY57 414 aa22.19■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 PDE1AP54750 535 aa22.19■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 LAMB2P55268 1798 aa22.18■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.18■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 CIAO1O76071 339 aa22.17■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 SERPINB2P05120 415 aa22.17■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 MX1P20591 662 aa22.17■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.17■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 CCDC125Q86Z20 511 aa22.17■■□□□ 1.14
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CBX1-201ENST00000225603 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.16■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 AACSQ86V21 672 aa22.16■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 CNBD1Q8NA66 436 aa22.16■■□□□ 1.14
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CBX1-201ENST00000225603 NPHP1O15259 732 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 MSL1Q68DK7 614 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 COL4A1P02462 1669 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 TTC22Q5TAA0 569 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 STAP2Q9UGK3 403 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.14■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 RTL9Q8NET4 1388 aa22.14■■□□□ 1.14
CBX1-201ENST00000225603 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.14■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 NLRP3Q96P20 1036 aa22.14■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 TNNI3KQ59H18 835 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 FBXO3Q9UK99 471 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.13■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.12■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 CASZ1Q86V15 1759 aa22.11■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 MMP10P09238 476 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 LRP5O75197 1615 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.1■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 TIMM10P62072 90 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 26
CBX1-201ENST00000225603 TAF1P21675 1872 aa22.09■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 METTL24Q5JXM2 366 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 SDSP20132 328 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 ST5P78524 1137 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.08■■□□□ 1.13
CBX1-201ENST00000225603 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.08■■□□□ 1.13
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