RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANOS1	P23352	680 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	GLRA1	P23415	457 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PSMA2	P25787	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PKLR	P30613	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPR183	P32249	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	UGT1A3	P35503	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRIM23	P36406	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	NDST2	P52849	883 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	GNB1	P62873	340 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	NUS1	Q96E22	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	INPP4B	O15327	924 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZW10	O43264	779 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DUX1	O43812	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	KIAA0513	O60268	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	HEXB	P07686	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	FUT1	P19526	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CD82	P27701	267 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MIP	P30301	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACTR1B	P42025	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAGEA1	P43355	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPR1	P46091	355 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CSNK1D	P48730	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	FHIT	P49789	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSD17B7	P56937	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACTR1A	P61163	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAX	P61244	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	NFATC2	Q13469	925 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DPYS	Q14117	519 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	NPW	Q8N729	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRR1	Q96L50	414 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SMARCA2-231	ENST00000634931	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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