RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627441.2

SPTAN1-212, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-212ENST00000627441 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 DUX4Q9UBX2 424 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 MEGF11A6BM72 1044 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PLOD3O60568 738 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SASH3O75995 380 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TGDSO95455 350 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PSMG1O95456 288 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 OPN1SWP03999 348 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF35P13682 527 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 MAPK12P53778 367 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ERVS71-1P61550 626 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 GLO1Q04760 184 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC29A2Q14542 456 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 RAB39AQ14964 217 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 OR4D1Q15615 310 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 RNF214Q8ND24 703 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CALML6Q8TD86 181 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 EXT2Q93063 718 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PRR25Q96S07 402 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 Q9N2J8 555 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 EXD2Q9NVH0 621 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 VWA7Q9Y334 891 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 NPTNQ9Y639 398 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 UPK1AO00322 258 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 GPR171O14626 319 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 UPK3AO75631 287 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 LHBP01229 141 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 GABRA3P34903 492 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TGFBR2P37173 567 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 MMP16P51512 607 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TEKQ02763 1124 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SYT14P1Q58G82 188 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF774Q6NX45 483 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM107Q6UX40 140 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CCDC89Q8N998 374 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PIGXQ8TBF5 258 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 LRRC39Q96DD0 335 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ERP27Q96DN0 273 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF75AQ96N20 296 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CDK15Q96Q40 435 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 DECR2Q9NUI1 292 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 HSPG2P98160 4391 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 H0YHG0 523 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 NGFRP08138 427 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 MAGEA8P43361 318 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 GATA4P43694 442 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SELENOPP49908 381 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 TAS2R39P59534 338 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC17A1Q14916 467 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 QPRTQ15274 297 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-212ENST00000627441 ZMYND11Q15326 602 aa6.68□□□□□ -1.34
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