RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623706.3

ATRX-212, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 2

Gene ATRX, Length 7,245 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-212ENST00000623706 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 FRS3O43559 492 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 CKMT1AP12532 417 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SDHBP21912 280 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 UBE2G1P62253 170 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 PLAURQ03405 335 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 USP17L24Q0WX57 530 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 DGKZQ13574 1117 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 MIDNQ504T8 468 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 LHX8Q68G74 356 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 LINGO4Q6UY18 593 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 FADS6Q8N9I5 356 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 FAM89AQ96GI7 184 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 S1PR5Q9H228 398 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 PRSS50Q9UI38 385 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SOCS6O14544 535 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 WDR1O75083 606 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 CNMDO75829 334 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 CYBBP04839 570 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 CD3EP07766 207 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 TMEM253P0C7T8 217 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ACRP10323 421 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 NAGAP17050 411 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ATP5JP18859 108 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZP3P21754 424 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 AQP1P29972 269 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ADMP35318 185 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ST3GAL1Q11201 340 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 PRSS8Q16651 343 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ECSCRQ19T08 205 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SERPINA11Q86U17 422 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 NT5CQ8TCD5 201 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 EDAQ92838 391 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZIM3Q96PE6 472 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ACSS2Q9NR19 701 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ABI3Q9P2A4 366 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 FZD1Q9UP38 647 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 NPTNQ9Y639 398 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 NUP155O75694 1391 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 TMEM150CB9EJG8 249 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 UMAD1C9J7I0 102 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 M0QZK8 103 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SEMA7AO75326 666 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 RBBP9O75884 186 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SLC2A10O95528 541 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 LIPCP11150 499 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 EDNRBP24530 442 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 LIPAP38571 399 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 PREPP48147 710 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 RABGGTBP53611 331 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 GPLD1P80108 840 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 PMS2P11Q13670 270 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 KEAP1Q14145 624 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 MTF1Q14872 753 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 HFEQ30201 348 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 GKN2Q86XP6 184 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 LGI4Q8N135 537 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 OR6V1Q8N148 313 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZFP90Q8TF47 636 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 BRK1Q8WUW1 75 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 RAX2Q96IS3 184 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 PTPN18Q99952 460 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-212ENST00000623706 ZPBPQ9BS86 351 aa3.25□□□□□ -1.89
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