RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615041.1

FAM49B-229, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 5 BASIC

Gene FAM49B, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-229	ENST00000615041	LAGE3	Q14657	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041		Q6ZR54	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041	MYH6	P13533	1939 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM49B-229	ENST00000615041		H3BMQ9	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041		K7EQM0	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	FCN1	O00602	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GMFG	O60234	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	NMT2	O60551	498 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ADCY5	O95622	1261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PGC	P20142	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	NOV	P48745	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PRMT2	P55345	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	UTF1	Q5T230	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CADM2	Q8N3J6	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	RIT2	Q99578	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	TXN2	Q99757	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041		Q9UF83	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SERPINA2	P20848	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	HPCAL1	P37235	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PRPH	P41219	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	MEOX2	P50222	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CBX1	P83916	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	FAM3C	Q92520	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	OMD	Q99983	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ABCB11	O95342	1321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	ZBTB5	O15062	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	MAGEB3	O15480	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GPX5	O75715	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	DEXI	O95424	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GNA11	P29992	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	PPT1	P50897	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	RAB40B	Q12829	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	SYPL1	Q16563	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-229	ENST00000615041	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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