RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 RTP4Q96DX8 246 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 IL37Q9NZH6 218 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MYLKQ15746 1914 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MYO7AQ13402 2215 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DEDDO75618 318 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GABRB3P28472 473 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CCKARP32238 428 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR51A7Q8NH64 312 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TAF1P21675 1872 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf98E9PRG8 122 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN6O43657 245 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SSTR4P31391 388 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CDKN2DP55273 166 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CD81P60033 236 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 APOOLQ6UXV4 268 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BLNKQ8WV28 456 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 OR4Q2P0C623 313 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TBPL1P62380 186 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CPZQ66K79 652 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ASPGQ86U10 573 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ARV1Q9H2C2 271 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KPTNQ9Y664 436 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ADM5C9JUS6 153 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0355O15063 1070 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GALTP07902 379 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 BCL6P41182 706 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HTR5AP47898 357 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TREML2Q5T2D2 321 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 VASNQ6EMK4 673 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HINT2Q9BX68 163 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 THSD1Q9NS62 852 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RTTNQ86VV8 2226 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FZD7O75084 574 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC43A1O75387 559 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FBP1P09467 338 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CBLP22681 906 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TACR3P29371 465 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SH3BP2P78314 561 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP6Q16828 381 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A12Q96S37 553 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 VAMP8Q9BV40 100 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A6O15403 523 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 HPNP05981 417 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINA2P20848 420 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DCTP40126 519 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TPMTP51580 245 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 LTB4RQ15722 352 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 FAM122BQ7Z309 247 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GVG6 124 aa6.54□□□□□ -1.36
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