RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611614.4

COPS7B-223, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, human

TSL 3 BASIC

Gene COPS7B, Length 2,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	PHF19	Q5T6S3	580 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SYT14	Q8NB59	555 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	HYLS1	Q96M11	299 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FN3K	Q9H479	309 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	WDR70	Q9NW82	654 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.76	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SPTB	P11277	2137 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614		A0A0G2JMP0	313 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614		J3QRE1	110 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	BHLHE40	O14503	412 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FLRT2	O43155	660 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF749	O43361	778 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	HPGDS	O60760	199 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	NKX2-2	O95096	273 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	BMP7	P18075	431 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SSTR4	P31391	388 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FXYD6P3	P58550	94 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	IL18	Q14116	193 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	CDK20	Q8IZL9	346 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	OTULIN	Q96BN8	352 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF559	Q9BR84	538 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	LNP1	A1A4G5	178 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FAM183A	A6NL82	134 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	RCBTB2	O95199	551 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	CBX7	O95931	251 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ARSB	P15848	533 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FUT1	P19526	365 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TBXA2R	P21731	343 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	HSD17B7	P56937	341 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	NIPAL3	Q6P499	406 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	LNX2	Q8N448	690 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	MARVELD3	Q96A59	401 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SCN2A	Q99250	2005 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614		A0A1B0GX78	115 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	SOX30	O94993	753 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	CEL	P19835	753 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	DRD5	P21918	477 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	OR1D4	P47884	311 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	BIK	Q13323	160 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ERV3-1	Q14264	604 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF613	Q6PF04	617 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TRIL	Q7L0X0	811 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	DGAT2	Q96PD7	388 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	OR6C1	Q96RD1	312 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	TMED9	Q9BVK6	235 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	RARRES3	Q9UL19	164 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	MED31	Q9Y3C7	131 aa		12.74	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614		H3BMH7	237 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	AGRP	O00253	132 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	HK1	P19367	917 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	M6PR	P20645	277 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	CTBP2	P56545	445 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	PLAUR	Q03405	335 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ZAR1	Q86SH2	424 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	UPRT	Q96BW1	309 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.73	□□□□□ -0.37
COPS7B-223	ENST00000611614	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		12.73	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms