RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599658.1

LSR-208, Transcript of lipolysis stimulated lipoprotein receptor, human

TSL 3

Gene LSR, Length 343 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LSR-208	ENST00000599658	IL6	P05231	212 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	NUDT7	P0C024	238 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	PRG2	P13727	222 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	IDO1	P14902	403 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	OR7A5	Q15622	319 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	GABRA6	Q16445	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ADAM19	Q9H013	955 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ALG2	Q9H553	416 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CDHR4	A6H8M9	788 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	PDLIM1	O00151	329 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	UBD	O15205	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	FRS3	O43559	492 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	DNPH1	O43598	174 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	THBS1	P07996	1170 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TFPT	P0C1Z6	253 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CXCR1	P25024	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CD40	P25942	277 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	IDUA	P35475	653 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	DSTN	P60981	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	HOXC5	Q00444	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	GNA13	Q14344	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TLCD1	Q96CP7	247 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TMEM19	Q96HH6	336 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	MUS81	Q96NY9	551 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	UPB1	Q9UBR1	384 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	RTTN	Q86VV8	2226 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	FAAH	O00519	579 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SSX4	O60224	188 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	PTAFR	P25105	342 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TTK	P33981	857 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CRISP3	P54108	245 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	GSTA3	Q16772	222 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	LIN52	Q52LA3	116 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	AAED1	Q7RTV5	226 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SERPINA11	Q86U17	422 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	PMM1	Q92871	262 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	MAL2	Q969L2	176 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ITCH	Q96J02	903 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	MDFI	Q99750	246 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	RMND5A	Q9H871	391 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LSR-208	ENST00000599658	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LSR-208	ENST00000599658	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.39	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms