RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM44Q2T9K0 475 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM178AQ8NBL3 297 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T33Q8NG76 320 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8D4Q8NGM9 314 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 NDEL1Q9GZM8 345 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 UBQLN3Q9H347 655 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 BAIAP2Q9UQB8 552 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 APC2O95996 2303 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ASAH2BP0C7U1 165 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM236Q5W0B7 351 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ENTHD1Q8IYW4 607 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TAAR8Q969N4 342 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SCMH1Q96GD3 660 aa28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
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CAPNS1-206ENST00000588815 BGLAPP02818 100 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS5P46782 204 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FXYD6P3P58550 94 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR85P60893 370 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCR4P61073 352 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBPC1Q00872 1141 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SULF2Q8IWU5 870 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf53Q8N6V4 93 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOXF1Q8NHV9 184 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD8Q96LT4 415 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC38A2Q96QD8 506 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 NPAS1Q99742 590 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGQQ9BRB3 760 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PTDSS2Q9BVG9 487 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MYRFQ9Y2G1 1151 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HIF3AQ9Y2N7 669 aa28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZIC3O60481 467 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 WISP1O95388 367 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2ABP04908 130 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGN1P05114 100 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 LYNP07948 512 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A6P31641 620 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFSF10P50591 281 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK5R2Q13319 367 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FHL1Q13642 323 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8J1Q8NGP2 316 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51A7Q8NH64 312 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD8Q8NHS3 518 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2ACQ93077 130 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF6Q9Y252 685 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa28.03■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV27A0A087WT01 109 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN19P0C672 248 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT14P1Q58G82 188 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf141Q5SZD1 244 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF786Q8N393 782 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TM9SF4Q92544 642 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MOGAT1Q96PD6 335 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2B2Q9GZK3 357 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 MCCC2Q9HCC0 563 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 URB1O60287 2271 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD7O75084 574 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 UCNP55089 124 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-206ENST00000588815 LTBQ06643 244 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HYAL4Q2M3T9 481 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PGGHGQ32M88 737 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-206ENST00000588815 LNX2Q8N448 690 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF696Q9H7X3 374 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-206ENST00000588815 CORINQ9Y5Q5 1042 aa28.02■■■□□ 2.08
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CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RAET1LQ5VY80 246 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCHD4Q6ZW05 846 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC17Q8N6Y2 441 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF566Q969W8 418 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11A1Q9GZK7 315 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ADNPQ9H2P0 1102 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-206ENST00000588815 QPCTLQ9NXS2 382 aa28.01■■■□□ 2.07
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