RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0G2JND7 137 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0G2JPF8 293 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF724A8MTY0 619 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 KLF4O43474 513 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 AKR7A3O95154 331 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GPIP06744 558 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 THBS1P07996 1170 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 IMPDH2P12268 514 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 IGHV1-2P23083 117 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 NCALDP61601 193 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC35A1P78382 337 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FADDQ13158 208 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CEACAM7Q14002 265 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 P2RY6Q15077 328 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF220Q5VTB9 566 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 Q6ZT83 130 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GPAT4Q86UL3 456 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 OR52N5Q8NH56 324 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PMM1Q92871 262 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGTQ969N2 578 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MUCL1Q96DR8 90 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 NGBQ9NPG2 151 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 VAPAQ9P0L0 249 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 UPB1Q9UBR1 384 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 IFT52Q9Y366 437 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 DSCAMO60469 2012 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PR80 420 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF716A6NP11 495 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 EVPLLA8MZ36 301 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR171O14626 319 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ANGPT2O15123 496 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF9O43307 516 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF208O43345 1280 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SASH3O75995 380 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PGM3O95394 542 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CD3EP07766 207 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ARAFP10398 606 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 GGT1P19440 569 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PTNP21246 168 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PPIBP23284 216 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 IL1RL1Q01638 556 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FAPQ12884 760 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SCARB2Q14108 478 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PPA1Q15181 289 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP51A1Q16850 503 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT73Q86Y46 540 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 C10orf111Q8N326 155 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HSD17B8Q92506 261 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ASB6Q9NWX5 421 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 FAAHO00519 579 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 HS3ST1O14792 307 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 DNPH1O43598 174 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT33AO76009 404 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-209ENST00000587957 AHSA1O95433 338 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms