RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXD1Q9GZZ0 328 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RHBDL2Q9NX52 303 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PADI1Q9ULC6 663 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A31A6NKX4 558 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 WISP1O95388 367 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 MAKP20794 623 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 LCN1P31025 176 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS19P39019 145 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD11B2P80365 405 aa23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB109BQ30KR1 87 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZK1Q5T2W1 519 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HSDL2Q6YN16 418 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX11GQ96HA9 241 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP19Q96LK0 163 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A2Q9BRI3 323 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF21Q9NSA1 209 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GWA3 101 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ADH7P40394 386 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9A3P48764 834 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR143P51810 404 aa23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 DEFA3P59666 94 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 NIPAL3Q6P499 406 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ULK3Q6PHR2 472 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR1F2PQ96R84 312 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF649Q9BS31 505 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVK13-1Q9NX77 482 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HAO2Q9NYQ3 351 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTA1P02549 2419 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 CPOQ8IVL8 374 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TM9SF4Q92544 642 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 AP3S1Q92572 193 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 POLHQ9Y253 713 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 CARD8Q9Y2G2 431 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPA7E9PJI5 369 aa23.25■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 NTN1O95631 604 aa23.24■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa23.24■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 PFN4Q8NHR9 129 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 CT55Q8WUE5 264 aa23.24■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR10A5Q9H207 317 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 FLRT3Q9NZU0 649 aa23.24■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARL4DP49703 201 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 DNASE1L3Q13609 305 aa23.23■■□□□ 1.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 CT45A2Q5DJT8 189 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2G6Q5TZ20 316 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SOHLH2Q9NX45 425 aa23.23■■□□□ 1.31
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