RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	POC5	Q8NA72	575 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MORN4	Q8NDC4	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	UFD1	Q92890	307 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LRR1	Q96L50	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WUU8	490 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN4	O14493	209 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC31A1	O15431	190 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IDH3B	O43837	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HCN1	O60741	890 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC19A2	O60779	497 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SNAPC5	O75971	98 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINA3	P01011	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNG	P01579	166 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QC	P02747	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP1B1	P05026	303 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT8	P05787	483 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CHRM4	P08173	479 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CPM	P14384	443 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ALOX12	P18054	663 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR1F	P30939	366 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LCN1	P31025	176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNS	P34059	522 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SDC2	P34741	201 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GRK5	P34947	590 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYBB2	P43320	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NUDT6	P53370	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB8A	P61006	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP3R1	P63098	170 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTC1	P68032	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTA1	P68133	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PSPH	P78330	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TAB1	Q15750	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPK11	Q15759	364 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZWC4	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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