RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568232.1

CLK3-222, Transcript of CDC like kinase 3, human

Gene CLK3, Length 958 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	DCST2	Q5T1A1	773 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	KRT80	Q6KB66	452 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	PIGU	Q9H490	435 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CLK3-222	ENST00000568232	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232		J3QLI3	93 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	AKAP10	O43572	662 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	SYNGR3	O43761	229 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	NCR1	O76036	304 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	MVK	Q03426	396 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	BAMBI	Q13145	260 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	DOK3	Q7L591	496 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	AAED1	Q7RTV5	226 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	STAC	Q99469	402 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232		M0R233	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	DNPH1	O43598	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	RP2	O75695	350 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	KRT33A	O76009	404 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	IMPDH2	P12268	514 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	MAGEA12	P43365	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	DAG1	Q14118	895 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	IMPG1	Q17R60	797 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	TMEM45B	Q96B21	275 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	MMP27	Q9H306	513 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	NOX3	Q9HBY0	568 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	PIP5K1B	O14986	540 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	CDC14B	O60729	498 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	RYK	P34925	604 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	PCGF2	P35227	344 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	NPRL3	Q12980	569 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	GPR68	Q15743	365 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CLK3-222	ENST00000568232	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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