RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP57	Q9NU63	452 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF25	Q9UIL4	384 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GGA2	Q9UJY4	613 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OARD1	Q9Y530	152 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NEDD4	P46934	1319 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY9	O60503	1353 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K5	Q99683	1374 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ANHX	E9PGG2	379 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8R	I6L899	631 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF195	O14628	629 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CASK	O14936	926 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GPAA1	O43292	621 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC8	O43402	210 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EFNA2	O43921	213 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GMDS	O60547	372 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSV	O60911	334 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	AP2A2	O94973	939 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ETHE1	O95571	254 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGR	P01833	764 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957		P04436	131 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	C4BPB	P20851	252 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	BCKDHB	P21953	392 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EDNRA	P25101	427 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GIF	P27352	417 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GCA	P28676	217 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA9	P31269	272 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PCK1	P35558	622 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CFHR2	P36980	270 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CSK	P41240	450 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT6	P51993	359 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SKP1	P63208	163 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LCN2	P80188	198 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PAX2	Q02962	417 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS1	Q08116	209 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	GNMT	Q14749	295 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC17A1	Q14916	467 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CD226	Q15762	336 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PGGHG	Q32M88	737 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf177	Q52M58	125 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53I3	Q53FA7	332 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NEPRO	Q6NW34	567 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC31	Q6UY01	552 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MOB2	Q70IA6	237 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CYS1	Q717R9	158 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM122B	Q7Z309	247 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC6	Q86X45	466 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCK	Q8N0W5	287 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SYS1	Q8N2H4	156 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM239	Q8WW34	195 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMD4	Q96H15	378 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	HINT2	Q9BX68	163 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NMUR1	Q9HB89	426 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	NANS	Q9NR45	359 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	BFAR	Q9NZS9	450 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC3	Q9P0I2	261 aa		2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
AKAP13-223	ENST00000560957	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	2.36	□□□□□ -2.03

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