RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560576.1

TMOD2-204, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 2,348 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-204ENST00000560576 UQCRC2P22695 453 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SERPINB5P36952 375 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 KHKP50053 298 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 MAP2K6P52564 334 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CHN2P52757 468 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CLDN8P56748 225 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 KCNJ10P78508 379 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 HPCAP84074 193 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SLC17A1Q14916 467 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 GPAT3Q53EU6 434 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 HPS1Q92902 700 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ROPN1LQ96C74 230 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 APOPT1Q96IL0 206 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 C3orf30Q96M34 536 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 MKS1Q9NXB0 559 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 DYSFO75923 2080 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 VSTM5A8MXK1 200 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 STAMBPO95630 424 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 G6PDP11413 515 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 UQCRBP14927 111 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ITGA2P17301 1181 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 EFNB3Q15768 340 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SMU1Q2TAY7 513 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CMIPQ8IY22 773 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 RAB8BQ92930 207 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 PLK3Q9H4B4 646 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CA10Q9NS85 328 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ASIC5Q9NY37 505 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CUBNO60494 3623 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 FAAHO00519 579 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 AP3D1O14617 1153 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 KLF11O14901 512 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 GPIP06744 558 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OR4A8P0C604 315 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 PCMT1P22061 227 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 GIFP27352 417 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 TACR3P29371 465 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 EMX2Q04743 252 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 RUNX1T1Q06455 604 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 GNA13Q14344 377 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ADIPOQQ15848 244 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SAXO2Q658L1 398 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 MECRQ9BV79 373 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 DPY30Q9C005 99 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 TACSTD2P09758 323 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 DAOP14920 347 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 SLC1A3P43003 542 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 NAAAQ02083 359 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 FUT5Q11128 374 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 CEACAM7Q14002 265 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 GSTA3Q16772 222 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD2-204ENST00000560576 VHLLQ6RSH7 139 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms