RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GALNT8	Q9NY28	637 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	AKAP6	Q13023	2319 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FAM221A	A4D161	298 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NPIPB7	O75200	414 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CGA	P01215	116 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GPI	P06744	558 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FES	P07332	822 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CD247	P20963	164 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KDELR2	P33947	212 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC7A2	P52569	658 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	H3F3A	P84243	136 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LIPE	Q05469	1076 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF613	Q6PF04	617 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FAM222B	Q8WU58	562 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PROX1	Q92786	737 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ALG2	Q9H553	416 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PIF1	Q9H611	641 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SELENON	Q9NZV5	590 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A0A0B4J2E0	115 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GWA3	101 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GX12	115 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	NME4	O00746	187 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GPR171	O14626	319 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FRS3	O43559	492 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR2T1	O43869	369 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FZD7	O75084	574 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	YES1	P07947	543 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	EPX	P11678	715 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	HTR2A	P28223	471 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	AGTR1	P30556	359 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	IDUA	P35475	653 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CPA2	P48052	419 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CRYBA2	P53672	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PSME3	P61289	254 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PIGX	Q8TBF5	258 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LZIC	Q8WZA0	190 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LIME1	Q9H400	295 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	RASSF1	Q9NS23	344 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	ABCA4	P78363	2273 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A0A087WUJ7	227 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549		A6NNC1	897 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	GOSR1	O95249	250 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	OPN1SW	P03999	348 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CCNA2	P20248	432 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM23-231	ENST00000557549	CPOX	P36551	454 aa		10.97	□□□□□ -0.65

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