RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAGE5	Q96GU1	130 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAT9	Q9BTE0	207 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPPP3	Q9BW30	176 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAB34	Q9BZG1	259 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	GLRX2	Q9NS18	164 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PAPOLA-222	ENST00000556787	DCTN6	O00399	190 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZSCAN12	O43309	604 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	IMPDH1	P20839	514 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPM6A	P51674	278 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SHH	Q15465	462 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	MICB	Q29980	383 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIGG	Q5H8A4	983 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	COX15	Q7KZN9	410 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMCO1	Q9UM00	188 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0G2JN53	185 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC182	A6NF36	153 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	IDS	B3KWA1	339 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787		E9PBE3	544 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	RIPK2	O43353	540 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	CXCR2	P25025	360 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXA9	P31269	272 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TFPI2	P48307	235 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACTA1	P68133	377 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPGS2	Q68CL5	300 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR9G1	Q8NH87	305 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF670	Q9BS34	389 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALG12	Q9BV10	488 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	EDEM2	Q9BV94	578 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL26	Q9NPH9	171 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARID1A	O14497	2285 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	PFKFB2	O60825	505 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNFSF13	O75888	250 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAG	P20916	626 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCR6	P51684	374 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNFRSF17	Q02223	184 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TP53I3	Q53FA7	332 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARPC1A	Q92747	370 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SIAE	Q9HAT2	523 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		3	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787		F5H6K3	240 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAPBP	O15533	448 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	AIRE	O43918	545 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	AP2A1	O95782	977 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	NMU	P48645	174 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLRC3	Q07444	240 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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