RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 C1orf140Q5VVS0 124 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ZNF613Q6PF04 617 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 P3H2Q8IVL5 708 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 RNF128Q8TEB7 428 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ABHD3Q8WU67 409 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 LZICQ8WZA0 190 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.11■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 CACNA1CQ13936 2221 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 A0A087WUJ7 227 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SLC35A1P78382 337 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 FXNQ16595 210 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 DEF8Q6ZN54 512 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 FAM214BQ7L5A3 538 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 GLRX2Q9NS18 164 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 JKAMPQ9P055 326 aa20.1■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 LIPT2A6NK58 231 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ZNF814B7Z6K7 855 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 CYTIPO60759 359 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 GMNNO75496 209 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 CTBP2P56545 445 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 OR7A5Q15622 319 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SPATS1Q496A3 300 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 LINC00114Q6XXX2 140 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 CCDC103Q8IW40 242 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 TUSC5Q8IXB3 177 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SLC43A2Q8N370 569 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 C1orf21Q9H246 121 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 MPDZO75970 2070 aa20.09■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 DNPH1O43598 174 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 RAMP1O60894 148 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 CGAP01215 116 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 GPIP06744 558 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PTNP21246 168 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 RPS5P46782 204 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 H3F3AP84243 136 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 LUZP2Q86TE4 346 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 TAAR8Q969N4 342 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PSD2Q9BQI7 771 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PTDSS2Q9BVG9 487 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 PIGMQ9H3S5 423 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 CHST11Q9NPF2 352 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 EMC9Q9Y3B6 208 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.08■□□□□ 0.81
BRF1-216ENST00000550208 HCFC1P51610 2035 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 PTPN13Q12923 2485 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 CHP2O43745 196 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 AKR7A3O95154 331 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 AHSA1O95433 338 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 YES1P07947 543 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 ASCL1P50553 236 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 IFI44LQ53G44 452 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 TMEM99Q8N816 258 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 ZNF610Q8N9Z0 462 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 KLHL13Q9P2N7 655 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.07■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 A8MXE2 369 aa20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 FTCDNL1E5RQL4 147 aa20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 AGTR1P30556 359 aa20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 TAS2R41P59536 307 aa20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
BRF1-216ENST00000550208 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms