RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SPATA21Q7Z572 469 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CMIPQ8IY22 773 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR10A6Q8NH74 314 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ST8SIA1Q92185 356 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADGRG7Q96K78 797 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KLHL15Q96M94 604 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 NANOGQ9H9S0 305 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ACER3Q9NUN7 267 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 IFT52Q9Y366 437 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GMEB1Q9Y692 573 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CDHR4A6H8M9 788 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CFAP73A6NFT4 308 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 INAFM1C9JVW0 142 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GSC2O15499 205 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 FRS3O43559 492 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TPST1O60507 370 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CCDC22O60826 627 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ATE1O95260 518 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SYNGR4O95473 234 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TFPIP10646 304 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PRG2P13727 222 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ETS2P15036 469 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ELK4P28324 431 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 UQCRC1P31930 480 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OPRM1P35372 400 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SIRPAP78324 504 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PPP2R2BQ00005 443 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 HOXC5Q00444 222 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EPS8Q12929 822 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MAPRE2Q15555 327 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CYP51A1Q16850 503 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LIN52Q52LA3 116 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 RABL3Q5HYI8 236 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LUZP2Q86TE4 346 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PTOV1Q86YD1 416 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CADM2Q8N3J6 435 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 BBS10Q8TAM1 723 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 LRRC58Q96CX6 371 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR5B2Q96R09 309 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MRGBPQ9NV56 204 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ZNF175Q9Y473 711 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PNV4 684 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GJE1A6NN92 205 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 M0QX08 132 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SYT5O00445 386 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 AIM2O14862 343 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SNX3O60493 162 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TNFSF13O75888 250 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 IL18BPO95998 194 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 COX4I1P13073 169 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TACR3P29371 465 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SLC7A1P30825 629 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 KIR2DL3P43628 341 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 SELENBP1Q13228 472 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 OR2A2Q6IF42 318 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-217ENST00000550044 VWA1Q6PCB0 445 aa8.59□□□□□ -1.03
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