RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533336.1

FNTA-210, Transcript of farnesyltransferase, CAAX box, alpha, humanhuman

TSL 3

Gene FNTA, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTA-210ENST00000533336 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 CADM2Q8N3J6 435 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SETD9Q8NE22 299 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ELOA3Q8NG57 546 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 PFN4Q8NHR9 129 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ZNF566Q969W8 418 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 UCK2Q9BZX2 261 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FKRPQ9H9S5 495 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FANCFQ9NPI8 374 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 LRFN1Q9P244 771 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.5□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 MPDZO75970 2070 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 BSNQ9UPA5 3926 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ZZEF1O43149 2961 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 A0A087WV48 116 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 A8MVM7 634 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 K7ENP7 123 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 PAX4O43316 350 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 DNPH1O43598 174 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 HCN1O60741 890 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 CBR3O75828 277 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 CXCR4P61073 352 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 C12orf73Q69YU5 71 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 FANK1Q8TC84 345 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 CYGBQ8WWM9 190 aa6.49□□□□□ -1.37
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FNTA-210ENST00000533336 SGTBQ96EQ0 304 aa6.49□□□□□ -1.37
FNTA-210ENST00000533336 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.49□□□□□ -1.37
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