RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 C3orf49Q96BT1 292 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ISOC1Q96CN7 298 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 LRR1Q96L50 414 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 SAMD8Q96LT4 415 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 COG8Q96MW5 612 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 IL4I1Q96RQ9 567 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 DPH1Q9BZG8 443 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ULBP3Q9BZM4 244 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 OR52D1Q9H346 318 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 UBQLN3Q9H347 655 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 DSN1Q9H410 356 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.86□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 CNIH4Q9P003 139 aa4.86□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 R4GN57 208 aa4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 ENO4A6NNW6 628 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 BHLHE40O14503 412 aa4.85□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 PLD2O14939 933 aa4.85□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 SLC25A12O75746 678 aa4.85□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 EVI2BP34910 448 aa4.85□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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CKAP5-211ENST00000532321 CD226Q15762 336 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TIGD6Q17RP2 521 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 EMC4Q5J8M3 183 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TCEAL6Q6IPX3 200 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 FDX2Q6P4F2 183 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 OPN5Q6U736 354 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 FAM198BQ6UWH4 519 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 APOOLQ6UXV4 268 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 TUBA1AQ71U36 451 aa4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CKAP5-211ENST00000532321 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.85□□□□□ -1.63
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