RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	GIF	P27352	417 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CCR7	P32248	378 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	GCK	P35557	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	OPRD1	P41143	372 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NSG1	P42857	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	IER3	P46695	156 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RGS4	P49798	205 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MS4A2	Q01362	244 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SEMG2	Q02383	582 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	KDSR	Q06136	332 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TGFBI	Q15582	683 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SNCB	Q16143	134 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	COPS8	Q99627	209 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	VGLL1	Q99990	258 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73	3e-13	■■■■□ 20.5
RPS13-208	ENST00000531908	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	BRCA2	P51587	3418 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1B0GU03	582 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908		A8MUI8	341 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GFY	I3L273	518 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PSMD11	O00231	422 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	AZIN1	O14977	448 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CHUK	O15111	745 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	UBD	O15205	165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RAD51B	O15315	384 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ENTPD5	O75356	428 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SUPT3H	O75486	399 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CRCP	O75575	148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	C4BPB	P20851	252 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GPX3	P22352	226 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	GPR183	P32249	361 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SLC1A3	P43003	542 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ACADVL	P49748	655 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ATP4B	P51164	291 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CCNG1	P51959	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FOXA1	P55317	472 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PKNOX1	P55347	436 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FOLH1	Q04609	750 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LCP2	Q13094	533 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RUNX3	Q13761	415 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ENPP2	Q13822	863 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS13-208	ENST00000531908	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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