RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 C16orf62Q7Z3J2 963 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 MIPOL1Q8TD10 442 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 XAGE5Q8WWM1 108 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ROPN1LQ96C74 230 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 RHOXF2Q9BQY4 288 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CA10Q9NS85 328 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TRAPPC4Q9Y296 219 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TMED7Q9Y3B3 224 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 WDR45Q9Y484 360 aa12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 AKR7A3O95154 331 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 VENTXO95231 258 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 STAMBPO95630 424 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TACR3P29371 465 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SERPINF1P36955 418 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 P2RY4P51582 365 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PRPS1P60891 318 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 KCNJ10P78508 379 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 HGFACQ04756 655 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TBRG1Q3YBR2 411 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 IFT20Q8IY31 132 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ANKFN1Q8N957 763 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 OR9K2Q8NGE7 335 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 OR4A15Q8NGL6 344 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TMEM45BQ96B21 275 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PLK3Q9H4B4 646 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 FKBP7Q9Y680 259 aa12.69□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TMEM129A0AVI4 362 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 DUXAA6NLW8 204 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ANKRD28O15084 1053 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 AK1P00568 194 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CHRM4P08173 479 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CECR9P0C854 216 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 BMP4P12644 408 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CFPP27918 469 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CLK1P49759 484 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SELENOPP49908 381 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CLDN8P56748 225 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SLC35A1P78382 337 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 BNIP2Q12982 314 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SQLEQ14534 574 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SYPL1Q16563 259 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 MSMPQ1L6U9 139 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SAXO2Q658L1 398 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TUBGCP3Q96CW5 907 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PPP1R36Q96LQ0 422 aa12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 A0A096LPE4 126 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 A0A1W2PPZ6 126 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 LIPT2A6NK58 231 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 HMGN4O00479 90 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TCF21O43680 179 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SPAG7O75391 227 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 UPK3AO75631 287 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CREB1P16220 341 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 HNF1AP20823 631 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 GIFP27352 417 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 NAAAQ02083 359 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CEACAM7Q14002 265 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 EFNB3Q15768 340 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 LIPNQ5VXI9 398 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ANKRD16Q6P6B7 361 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PAQR6Q6TCH4 344 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 AAED1Q7RTV5 226 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 CARM1Q86X55 608 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 RFLNBQ8N5W9 214 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 NATD1Q8N6N6 113 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 BOD1Q96IK1 185 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 APOPT1Q96IL0 206 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SNX18Q96RF0 628 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 SLC38A1Q9H2H9 487 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 EXD2Q9NVH0 621 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PARPBPQ9NWS1 579 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 PCDHGB4Q9UN71 923 aa12.67□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 B9A039 149 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ZNF208O43345 1280 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 KCNAB3O43448 404 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 ITM2AO43736 263 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 WNT11O96014 354 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 GUSBP08236 651 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 TACSTD2P09758 323 aa12.66□□□□□ -0.38
BRMS1-208ENST00000530756 DAOP14920 347 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms