RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA2E9PIF3 369 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC42EP2O14613 210 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHG3P01860 377 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IMPDH2P12268 514 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ELK4P28324 431 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OMPP47874 163 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 EME1Q96AY2 570 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 DDIT4LQ96D03 193 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 TIMP4Q99727 224 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.45■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF208O43345 1280 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP24386 653 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7A5Q15622 319 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 VASNQ6EMK4 673 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 PIGXQ8TBF5 258 aa20.44■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGDIAP52565 204 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN18P56856 261 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5M9Q8NGP3 310 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL15Q96M94 604 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR137Q96N19 417 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 EI24O14681 340 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 DAPP51397 102 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IL1RL1Q01638 556 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKCDQ05655 676 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 STK35Q8TDR2 534 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 HCN1O60741 890 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 AHSA1O95433 338 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF74Q16587 644 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OR13C2Q8NGS9 318 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SGTBQ96EQ0 304 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 DIO1P49895 249 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 TDGF1P3P51864 188 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2B6P58173 313 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SVOPLQ8N434 492 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 WBP1Q96G27 269 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CXCL13O43927 109 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 BGLAPP02818 100 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF708P17019 499 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 IDUAP35475 653 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OR51A7Q8NH64 312 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10D3Q8NH80 312 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC19A3Q9BZV2 496 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC13O75165 2243 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SVILO95425 2214 aa20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1B0GVC2 190 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 LIPT2A6NK58 231 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF814B7Z6K7 855 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 SULT2B1O00204 365 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 AKR7A3O95154 331 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTL6AO96019 429 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 PRB1P04280 392 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 GCKP35557 465 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 CTBP2P56545 445 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM69AQ5T7M9 428 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 HBMQ6B0K9 141 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM8Q8N371 416 aa20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1-208ENST00000524325 OSTF1Q92882 214 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms