RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516299.1

RNU6-1232P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1232, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1232P, Length 86 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SCN2BO60939 215 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CCNKO75909 580 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 YIF1AO95070 293 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RAB3DO95716 219 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TSPAN13O95857 204 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 HLA-DQB1P01920 261 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RLN1P04808 185 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PYGLP06737 847 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 OR52Z1P0C646 297 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF735P0CB33 412 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 C8orf89P0DMQ9 161 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CLUP10909 449 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ETS2P15036 469 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF18P17022 549 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ATP6V1B2P21281 511 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CNR1P21554 472 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC2A5P22732 501 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AQP1P29972 269 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ADRA1AP35348 466 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 COPB2P35606 906 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FRKP42685 505 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MAGEA8P43361 318 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SYKP43405 635 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RFX3P48380 749 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PITPNBP48739 271 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ACOT2P49753 483 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CCL23P55773 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 HAND2P61296 217 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DCAF7P61962 342 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ERVK-25P63136 954 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FKBP1BP68106 108 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IL5RAQ01344 420 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TGM3Q08188 693 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AP1B1Q10567 949 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PPIL2Q13356 520 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 BTN1A1Q13410 526 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 VGLL4Q14135 290 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KRT32Q14532 448 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PSG5Q15238 335 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 STX1AQ16623 288 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TSTQ16762 297 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDO1Q16878 200 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TTLL9Q3SXZ7 439 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PCOTHQ58A44 107 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM222AQ5U5X8 452 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PM20D1Q6GTS8 502 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KLHL10Q6JEL2 608 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC25A25Q6KCM7 469 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 UFSP1Q6NVU6 142 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PRSS54Q6PEW0 395 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 C4orf50Q6ZRC1 276 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 UTS2BQ765I0 119 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KBTBD6Q86V97 674 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SERPINA9Q86WD7 417 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CBWD2Q8IUF1 395 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MFSD6LQ8IWD5 586 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDH26Q8IXH8 852 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KLHL7Q8IXQ5 586 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 APCDD1Q8J025 514 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MUC15Q8N387 334 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NKAPP1Q8N9T2 125 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IQUBQ8NA54 791 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LEMD2Q8NC56 503 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 C19orf18Q8NEA5 215 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LFNGQ8NES3 379 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ACTL9Q8TC94 416 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ABHD3Q8WU67 409 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ST8SIA1Q92185 356 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RAPGEF5Q92565 580 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ESR2Q92731 530 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 HGDQ93099 445 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 YIPF5Q969M3 257 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TM4SF19Q96DZ7 209 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 COG3Q96JB2 828 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CXorf58Q96LI9 332 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MUS81Q96NY9 551 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GCNAQ96QF7 691 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CYP2S1Q96SQ9 504 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AGPAT1Q99943 283 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms