RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 FGF4P08620 206 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 LINC00032P0C843 101 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 GAAP10253 952 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ADRA2CP18825 462 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SERPINB5P36952 375 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ATP12AP54707 1039 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SESN3P58005 492 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SCGB2A2Q13296 93 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ADRM1Q16186 407 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 MSMPQ1L6U9 139 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 KANK2Q63ZY3 851 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CDK20Q8IZL9 346 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ZNF614Q8N883 585 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 RNF217Q8TC41 542 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CDS1Q92903 461 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 LRRC58Q96CX6 371 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 KATNB1Q9BVA0 655 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.65□□□□□ -0.86
RNF4-218ENST00000513284 NR5A2O00482 541 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CFLARO15519 480 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 WNT11O96014 354 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 PNPP00491 289 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 IGLV1-44P01699 117 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 ADRA2AP08913 450 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CECR9P0C854 216 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 BCKDHAP12694 445 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 MPGP29372 298 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CBFBQ13951 182 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SYT14P1Q58G82 188 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 DCST2Q5T1A1 773 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 OR2T11Q8NH01 316 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SFXN5Q8TD22 340 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TMEM234Q8WY98 164 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.64□□□□□ -0.87
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RNF4-218ENST00000513284 YIPF5Q969M3 257 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TPK1Q9H3S4 243 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 MKS1Q9NXB0 559 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 UPB1Q9UBR1 384 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.63□□□□□ -0.87
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RNF4-218ENST00000513284 FSHBP01225 129 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CRYAAP02489 173 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 HPXP02790 462 aa9.63□□□□□ -0.87
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RNF4-218ENST00000513284 UBL4AP11441 157 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 NPR2P20594 1047 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 PRPS1L1P21108 318 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SOAT1P35610 550 aa9.63□□□□□ -0.87
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RNF4-218ENST00000513284 TUBA1BP68363 451 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TUBA4AP68366 448 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 IL1RL1Q01638 556 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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RNF4-218ENST00000513284 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 CASP12Q6UXS9 341 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 TUBA1AQ71U36 451 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 SPATA21Q7Z572 469 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 NUP37Q8NFH4 326 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 PIGXQ8TBF5 258 aa9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RNF4-218ENST00000513284 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.63□□□□□ -0.87
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