RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TPOP07202 933 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-221ENST00000511747 SRMP19623 302 aa24.87■■□□□ 1.57
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SH3BP2-221ENST00000511747 SLITRK4Q8IW52 837 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC28AQ8IWP9 274 aa24.87■■□□□ 1.57
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SH3BP2-221ENST00000511747 C20orf85Q9H1P6 137 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD10Q9NXR5 420 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00862A6NCI5 91 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 DNASE1P24855 282 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-221ENST00000511747 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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