RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 FLOT1O75955 427 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PDE5AO76074 875 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 IGHG1P01857 330 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RPSAP08865 295 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ACADSP16219 412 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TNNI1P19237 187 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ANOS1P23352 680 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PPP2R1BP30154 601 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC11A1P49279 550 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 ART1P52961 327 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DAOAP59103 153 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 S100A12P80511 92 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CUL1Q13616 776 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 GGTA1PQ4G0N0 100 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PLCXD3Q63HM9 321 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PQLC3Q8N755 202 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR1L4Q8NGR5 311 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR4C3Q8NH37 302 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA3Q8NHX4 192 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 GPX8Q8TED1 209 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 MEIS3Q99687 375 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TSG101Q99816 390 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 P2RY13Q9BPV8 354 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM175Q9BSA9 504 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CABLES2Q9BTV7 478 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 C3orf14Q9HBI5 128 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SIX2Q9NPC8 291 aa1.9□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 LCMT1Q9UIC8 334 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OARD1Q9Y530 152 aa1.9□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SH3TC1Q8TE82 1336 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LTBP2Q14767 1821 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ROBO3Q96MS0 1386 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MED23Q9ULK4 1368 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ERICH2A1L162 156 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CD8B2A6NJW9 211 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 ANXA13P27216 316 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 HPCAL1P37235 193 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MAP3K8P41279 467 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 MNAT1P51948 309 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ATP12AP54707 1039 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DSCR9P59020 149 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 FADDQ13158 208 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 NDUFA9Q16795 377 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 H3F3CQ6NXT2 135 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC38A6Q8IZM9 456 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM123Q8N131 208 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 MAIP1Q8WWC4 291 aa1.89□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 TM4SF19Q96DZ7 209 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CHMP6Q96FZ7 201 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa1.89□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
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