RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PRF1	P14222	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TACR3	P29371	465 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CASP3	P42574	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR4	P46093	362 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GAS1	P54826	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CDK5	Q00535	292 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	QPRT	Q15274	297 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SGTB	Q96EQ0	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954		Q96MT0	163 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GPA33	Q99795	319 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A087WXM4	84 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PRSS44	E7EML9	344 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	HCN1	O60741	890 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SOX14	O95416	240 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	HMGN1	P05114	100 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ELK4	P28324	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC9A3	P48764	834 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MAP2K6	P52564	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954		Q0VFX4	171 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PFN4	Q8NHR9	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ST8SIA1	Q92185	356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MED11	Q9P086	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SH3D21	A4FU49	640 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAM10	O14672	748 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	GMFG	O60234	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PTP4A3	O75365	173 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC25A12	O75746	678 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SNX4	O95219	450 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	NTN1	O95631	604 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CLPTM1	O96005	669 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	FUT1	P19526	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	MAK	P20794	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CRHBP	P24387	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	PTGDS	P41222	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CYB561	P49447	251 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	HLCS	P50747	726 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	DLX5	P56178	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	TUBA4A	P68366	448 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CIZ1-223	ENST00000491954	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms