RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CIB2O75838 187 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 AQP1P29972 269 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 HLCSP50747 726 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 BIDP55957 195 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF45Q02386 682 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 BST1Q10588 318 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 GRB7Q14451 532 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OXA1LQ15070 435 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 EOGTQ5NDL2 527 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RNF139Q8WU17 664 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 UFD1Q92890 307 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PAGE5Q96GU1 130 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALT6Q96L58 329 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 NICN1Q9BSH3 213 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 BTNL2Q9UIR0 455 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-212ENST00000491302 CCDC182A6NF36 153 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 HAS3O00219 553 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SNAPINO95295 136 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TAF6P49848 677 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CDK16Q00536 496 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 KYAT1Q16773 422 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP7Q16829 419 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR52E8Q6IFG1 317 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 VRK2Q86Y07 508 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ALLCQ8N6M5 410 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 NUS1Q96E22 293 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H4GQ99525 98 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 NIPAL2Q9H841 368 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CD274Q9NZQ7 290 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 EPOPA6NHQ4 379 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 HCRTR1O43613 425 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CD1CP29017 333 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 GDI1P31150 447 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 DDOSTP39656 456 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OPRD1P41143 372 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 MICBQ29980 383 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PARP15Q460N3 678 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 PGAP1Q75T13 922 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR2AP1Q8NGE2 309 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC77Q9BR77 488 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH5Q9NX47 278 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM9Q9P0T7 183 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 STAMBPO95630 424 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-48P01763 117 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CARD16Q5EG05 197 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RASD2Q96D21 266 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB18Q96M61 343 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 EBF4Q9BQW3 602 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 STAP1Q9ULZ2 295 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 V9GY05 133 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-212ENST00000491302 LGI1O95970 557 aa5.59□□□□□ -1.51
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