RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF23P17027 643 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 SERPINF1P36955 418 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD46Q86W74 232 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 DDIT4LQ96D03 193 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 C1orf159Q96HA4 380 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 APOPT1Q96IL0 206 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 PPCSQ9HAB8 311 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 POLE3Q9NRF9 147 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 TLDC2A0PJX2 215 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 LRP5LA4QPB2 252 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 AGR2O95994 175 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 PGRP06401 933 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 GUSBP08236 651 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 TACR3P29371 465 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 HTR3AP46098 478 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 GPAT3Q53EU6 434 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 VHLLQ6RSH7 139 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 AAED1Q7RTV5 226 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM99Q8N816 258 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 PMM1Q92871 262 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 CA10Q9NS85 328 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF208O43345 1280 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 SPAG7O75391 227 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 AKR7A3O95154 331 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 UQCRC2P22695 453 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 EMX2Q04743 252 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ADIPOQQ15848 244 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM45BQ96B21 275 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 MKS1Q9NXB0 559 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 B9A039 149 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 SCN2BO60939 215 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 KRT33AO76009 404 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 CRYAAP02489 173 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 C1QCP02747 245 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 OR4A8P0C604 315 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 HPCAP84074 193 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 LGALS3BPQ08380 585 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 CEACAM7Q14002 265 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 OR7A5Q15622 319 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 SAXO2Q658L1 398 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 GPAT4Q86UL3 456 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 NR5A2O00482 541 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TCF21O43680 179 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 STAMBPO95630 424 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 LGI1O95970 557 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ITGA2P17301 1181 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 IL2RGP31785 369 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 SLC1A3P43003 542 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 KHKP50053 298 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TUBA1BP68363 451 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TUBA4AP68366 448 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 SYPL1Q16563 259 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TUBA1AQ71U36 451 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ANKFN1Q8N957 763 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 DPY30Q9C005 99 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 PLK3Q9H4B4 646 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 ASIC5Q9NY37 505 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 LIPT2A6NK58 231 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-217ENST00000489581 HMGN4O00479 90 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms