RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 GAL3ST1Q99999 423 aa3.89□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 SLC1A5Q15758 541 aa3.88□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.88□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 ZBP1Q9H171 429 aa3.88□□□□□ -1.79
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CCL20-204ENST00000489160 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.88□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.88□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 AHSPQ9NZD4 102 aa3.88□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 MRC2Q9UBG0 1479 aa3.87□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.87□□□□□ -1.79
CCL20-204ENST00000489160 E9PAM4 449 aa3.87□□□□□ -1.79
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