RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 C1orf94Q6P1W5 598 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SIAH3Q8IW03 269 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 PM20D2Q8IYS1 436 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SLC43A2Q8N370 569 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 EME1Q96AY2 570 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 VCXQ9H320 206 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 LDAHQ9H6V9 325 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TIGARQ9NQ88 270 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RHCGQ9UBD6 479 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZFHX3Q15911 3703 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SHANK1Q9Y566 2161 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TMEM72A0PK05 275 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 OR10H3O60404 316 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 PMS2P2O95744 297 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 HPRP00739 348 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ADAP00813 363 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 CPN1P15169 458 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SLC9A3P48764 834 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RFX4Q33E94 735 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 CMPK2Q5EBM0 449 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 VASNQ6EMK4 673 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TRILQ7L0X0 811 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 GHDCQ8N2G8 530 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 MEIOBQ8N635 442 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 OR52J3Q8NH60 311 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 FAR1Q8WVX9 515 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SARAFQ96BY9 339 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZNF524Q96C55 264 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SGTBQ96EQ0 304 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 KLHL15Q96M94 604 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 GPR137Q96N19 417 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RDH12Q96NR8 316 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TAAR6Q96RI8 345 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 KLHDC3Q9BQ90 382 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 FKRPQ9H9S5 495 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 USE1Q9NZ43 259 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 U3KQV3 271 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ITPR3Q14573 2671 aa10.54□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 H0YJX3 145 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 BCKDKO14874 412 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 EFNA2O43921 213 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 FPR3P25089 353 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 IDUAP35475 653 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RFC3P40938 356 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 UGT2B15P54855 530 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 NUP107P57740 925 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 EGR4Q05215 589 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN31Q12999 210 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TRIP10Q15642 601 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 FAHD1Q6P587 224 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 STK32CQ86UX6 486 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 NRMQ8IXM6 262 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 SCAIQ8N9R8 606 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 Q8NA96 180 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-211ENST00000488243 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms