RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 CCR6P51684 374 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 ASPHQ12797 758 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PARP15Q460N3 678 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PIGGQ5H8A4 983 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PP632Q6XCG6 107 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 ZNF573Q86YE8 665 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 RAB7BQ96AH8 199 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 A8MUI8 341 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 TDGF1P13385 188 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 ZNF44P15621 663 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 CMA1P23946 247 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 HOXA9P31269 272 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 TDGF1P3P51864 188 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 HTD2P86397 168 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 NPBQ8NG41 125 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 C4orf36Q96KX1 117 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 ALG12Q9BV10 488 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 TBX21Q9UL17 535 aa3.53□□□□□ -1.84
USP34-216ENST00000487547 ATP8B3O60423 1300 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TAPBPO15533 448 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 UGT1A9O60656 530 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IDH1O75874 414 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 ADCY5O95622 1261 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 DIRAS3O95661 229 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 HPGDP15428 266 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 CXCR2P25025 360 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 ATP6AP1Q15904 470 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 BEND3Q5T5X7 828 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 LRRC31Q6UY01 552 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 CCDC50Q8IVM0 306 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SYT14Q8NB59 555 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 FAM3CQ92520 227 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.52□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IDSB3KWA1 339 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 AIREO43918 545 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SPAG7O75391 227 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TNFSF13O75888 250 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IGHG4P01861 327 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 FMO3P31513 532 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SLC26A3P40879 764 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 NMUP48645 174 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TNFRSF17Q02223 184 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 MICBQ29980 383 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 ARPC1AQ92747 370 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 FCRL1Q96LA6 429 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 RAB34Q9BZG1 259 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IL26Q9NPH9 171 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 GLRX2Q9NS18 164 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 AURKCQ9UQB9 309 aa3.51□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 STAMBPO95630 424 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 MOSP00540 346 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 IMPDH1P20839 514 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 PKNOX1P55347 436 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TP53I3Q53FA7 332 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 TPGS2Q68CL5 300 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 PAQR7Q86WK9 346 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.5□□□□□ -1.85
USP34-216ENST00000487547 OR9G1Q8NH87 305 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms