RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SH3D21A4FU49 640 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 LIPT2A6NK58 231 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 A6NNC1 897 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C16orf97H3BN30 126 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 AIM2O14862 343 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C8BP07358 591 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 IDUAP35475 653 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM7Q14002 265 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 VEZF1Q14119 521 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 NRF1Q16656 503 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C6orf89Q6UWU4 347 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 BEND4Q6ZU67 534 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 STK35Q8TDR2 534 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 NDRG3Q9UGV2 375 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 EDNRAP25101 427 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A1P53985 500 aa18.6■□□□□ 0.57
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ACTB-211ENST00000480301 OR1Q1Q15612 314 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OR7A5Q15622 319 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C1orf140Q5VVS0 124 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ERICH5Q6P6B1 374 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 STAC2Q6ZMT1 411 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 STK32CQ86UX6 486 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 PIGXQ8TBF5 258 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
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ACTB-211ENST00000480301 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 CSMD1Q96PZ7 3565 aa18.6■□□□□ 0.57
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ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GX12 115 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 FAM220BPB1ANY3 271 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 M0R3H8 397 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 GPIP06744 558 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OR3A2P47893 321 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 NPTX1Q15818 432 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ELOA3BQ3SY89 546 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 FAM91A1Q658Y4 838 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ULK3Q6PHR2 472 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 HACD2Q6Y1H2 254 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 C22orf34Q6ZV56 151 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TMEM200AQ86VY9 491 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TMEM99Q8N816 258 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 ELOA3Q8NG57 546 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OR4D11Q8NGI4 311 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TMEM27Q9HBJ8 222 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 RASSF1Q9NS23 344 aa18.59■□□□□ 0.57
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ACTB-211ENST00000480301 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 DCHS2Q6V1P9 2916 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-211ENST00000480301 TEX15Q9BXT5 2789 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FMO6PO60774 539 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 AKR7A3O95154 331 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PRDX6P30041 224 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 NTF4P34130 210 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 NCALDP61601 193 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ALG10BQ5I7T1 473 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.58■□□□□ 0.56
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ACTB-211ENST00000480301 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 OR2T12Q8NG77 320 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A7Q8TE54 656 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A4Q969I6 547 aa18.58■□□□□ 0.56
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ACTB-211ENST00000480301 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 MCHR1Q99705 422 aa18.58■□□□□ 0.56
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ACTB-211ENST00000480301 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FANCFQ9NPI8 374 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 EMC3Q9P0I2 261 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PRSS50Q9UI38 385 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 AP3M1Q9Y2T2 418 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 GPR171O14626 319 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 PNMTP11086 282 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 P2RY4P51582 365 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SLC17A1Q14916 467 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 MFSD8Q8NHS3 518 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 POLQO75417 2590 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-211ENST00000480301 SPG11Q96JI7 2443 aa18.57■□□□□ 0.56
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