RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	HK1	P19367	917 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	NOS3	P29474	1203 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	GSTT1	P30711	240 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CASP3	P42574	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MTNR1A	P48039	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	DLX5	P56178	289 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PRPS1	P60891	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	LTB	Q06643	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435		Q0VFX4	171 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB40B	Q12829	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXF1	Q12946	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CPO	Q8IVL8	374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	OTULIN	Q96BN8	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CRELD1	Q96HD1	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	FKRP	Q9H9S5	495 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435		A8MVM7	634 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435		H3BMQ9	156 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435		M0R3G1	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MYL12B	O14950	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	APOL3	O95236	402 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	AHSA1	O95433	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MT-ATP6	P00846	226 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINA7	P05543	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PEPD	P12955	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CD82	P27701	267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	HTR1F	P30939	366 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	UQCRC1	P31930	480 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	AQP2	P41181	271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TMBIM6	P55061	237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	SNTA1	Q13424	505 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	CRMP1	Q14194	572 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	COG8	Q96MW5	612 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	DOK1	Q99704	481 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	MED20	Q9H944	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	HPF1	Q9NWY4	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-231	ENST00000467435	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NPIPB7	O75200	414 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	HIST1H2AB	P04908	130 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL3	P10147	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MYL12A	P19105	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ACVR2A	P27037	513 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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