RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274		A0A0A6YYD5	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PLPP1	O14494	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GMFG	O60234	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FADS1	O60427	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	STK16	O75716	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZFPL1	O95159	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ADRA2A	P08913	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ELK4	P28324	431 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SFTPD	P35247	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CHIT1	Q13231	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GABRA6	Q16445	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	DECR1	Q16698	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274		A0A1W2PRB8	838 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274		C9JVG2	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GPR171	O14626	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CYTIP	O60759	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TTC4	O95801	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC7A1	P30825	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	GP5	P40197	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	RAD52	P43351	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	EVX1	P49640	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CDKN2D	P55273	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MGAT2	Q10469	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CHP1	Q99653	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCL-208	ENST00000466274	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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