RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 BEST3Q8N1M1 668 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CRELD1Q96HD1 420 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SAMD8Q96LT4 415 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PIGQQ9BRB3 760 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 IFT27Q9BW83 186 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ASPNQ9BXN1 380 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PROK2Q9HC23 129 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CMC2Q9NRP2 79 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 RASSF1Q9NS23 344 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.71□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM72A0PK05 275 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 A6NHS1 94 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PTGES3LE9PB15 166 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 BHLHE40O14503 412 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SURF4O15260 269 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PRODHO43272 600 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 DNPH1O43598 174 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 RGS10O43665 173 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 AHCYL1O43865 530 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PIP5K1CO60331 668 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FAM20BO75063 409 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FZD7O75084 574 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SOX14O95416 240 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TXNDC12O95881 172 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 BGLAPP02818 100 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CD14P08571 375 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 MST1P26927 711 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 NOS3P29474 1203 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 RAC1P63000 192 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35A2P78381 396 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 LGALS3BPQ08380 585 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CLN3Q13286 438 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 MFAP5Q13361 173 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 APOFQ13790 326 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TGIF1Q15583 401 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SGCBQ16585 318 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 GID4Q8IVV7 300 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 OR5J2Q8NH18 312 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 OR51A7Q8NH64 312 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FANK1Q8TC84 345 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FCGR1BQ92637 280 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 TAAR8Q969N4 342 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SNX18Q96RF0 628 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 FANCFQ9NPI8 374 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.7□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf72A6NCS6 295 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 OR5H15A6NDH6 313 aa8.69□□□□□ -1.02
HDLBP-211ENST00000425989 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms