RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423742.1

AFG3L1P-207, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L1P, Length 1,012 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-207ENST00000423742 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.14■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ROS1P08922 2347 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ANGPT2O15123 496 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 PLAUP00749 431 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 IGHV1-2P23083 117 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 PAQR6Q6TCH4 344 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CASP12Q6UXS9 341 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 GMEB1Q9Y692 573 aa20.13■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 DSCAMO60469 2012 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 LIPT2A6NK58 231 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 A8MVM7 634 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SMPD2O60906 423 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 AKR7A3O95154 331 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 GPX2P18283 190 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 COX5AP20674 150 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLC6A2P23975 617 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 PRKAR1BP31321 381 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 NTF4P34130 210 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SCARB2Q14108 478 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 WFDC11Q8NEX6 87 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 C3orf49Q96BT1 292 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ADPRHL2Q9NX46 363 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 MTORP42345 2549 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 GGT1P19440 569 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 AQP1P29972 269 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 C1orf140Q5VVS0 124 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM99Q8N816 258 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLC35B4Q969S0 331 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 MUCL1Q96DR8 90 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ZNF607Q96SK3 696 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 PIP5K1AQ99755 562 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ASB6Q9NWX5 421 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 VPS13CQ709C8 3753 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CIB4A0PJX0 185 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CLOCKO15516 846 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RAD51DO75771 328 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 HOXC12P31275 282 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 FAPQ12884 760 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLC17A1Q14916 467 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 PPA1Q15181 289 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CYP51A1Q16850 503 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 GPAT4Q86UL3 456 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 P3H2Q8IVL5 708 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 HS3ST1O14792 307 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TPST1O60507 370 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CD3EP07766 207 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 MTPNP58546 118 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 NFYCQ13952 458 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ADRM1Q16186 407 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TMEM225Q6GV28 225 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 RETREG3Q86VR2 466 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 COMTD1Q86VU5 262 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 DPP10Q8N608 796 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 HIPK4Q8NE63 616 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ELOA3Q8NG57 546 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 CGREF1Q99674 301 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 TAS2R16Q9NYV7 291 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 UPB1Q9UBR1 384 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 MALT1Q9UDY8 824 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-207ENST00000423742 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 491.3 ms