RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 ADH7P40394 386 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RFX3P48380 749 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RGS6P49758 472 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SLC37A1P57057 533 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 DCAF7P61962 342 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TUBA1BP68363 451 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ACY1Q03154 408 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OCA2Q04671 838 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 DGUOKQ16854 277 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TUBA1AQ71U36 451 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CDK20Q8IZL9 346 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF614Q8N883 585 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 NDNFQ8TB73 568 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TSLPQ969D9 159 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 VMP1Q96GC9 406 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PALMDQ9NP74 551 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FGF21Q9NSA1 209 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CCRL2O00421 344 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CDC42EP2O14613 210 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 RCBTB2O95199 551 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 IL33O95760 270 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 SCG5P05408 212 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ALAS2P22557 587 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 GADD45AP24522 165 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 GAS1P54826 345 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PER3P56645 1201 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 NCS1P62166 190 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 USP43Q70EL4 1123 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF527Q8NB42 609 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PFN4Q8NHR9 129 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 BORCS5Q969J3 196 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 LGALS12Q96DT0 336 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OPALINQ96PE5 141 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MGLLQ99685 303 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 OR52D1Q9H346 318 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 FN3KQ9H479 309 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM129A0AVI4 362 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 OR2W5A6NFC9 320 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 MYL12BO14950 172 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 MAKP20794 623 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 ENTPD1P49961 510 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 GPR143P51810 404 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 VBP1P61758 197 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 PSPHP78330 225 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 MED22Q15528 200 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 KLHL26Q53HC5 615 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 ULK3Q6PHR2 472 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 GID4Q8IVV7 300 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 SAMD8Q96LT4 415 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 DACH2Q96NX9 599 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 OR5M11Q96RB7 305 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 UBQLN3Q9H347 655 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 HHATLQ9HCP6 504 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 OSGIN1Q9UJX0 560 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRC-206ENST00000413409 OR6C76A6NM76 312 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms