RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 DUSP26Q9BV47 211 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 FKBP7Q9Y680 259 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM13O60858 407 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 C1QCP02747 245 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SERPINF1P36955 418 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PRPS1P60891 318 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 LGALS3BPQ08380 585 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SLC17A1Q14916 467 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 XKR7Q5GH72 579 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 C6orf136Q5SQH8 315 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MGARPQ8TDB4 240 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 RAB8BQ92930 207 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 OR51I1Q9H343 314 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM72A0PK05 275 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 AP3D1O14617 1153 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TCF21O43680 179 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 LILRA1O75019 489 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 OR12D1P0DN82 309 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 CFPP27918 469 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MAPK1P28482 360 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MPGP29372 298 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ALDH3A1P30838 453 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ARRB2P32121 409 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 LSP1P33241 339 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 FUT5Q11128 374 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ADIPOQQ15848 244 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PGS1Q32NB8 556 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 VHLLQ6RSH7 139 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 GRINAQ7Z429 371 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TCP10LQ8TDR4 215 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MOAP1Q96BY2 351 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SLC35G5Q96KT7 338 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MECRQ9BV79 373 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 CA10Q9NS85 328 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 DUXAA6NLW8 204 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 NR5A2O00482 541 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD28O15084 1053 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 DNPH1O43598 174 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 STAMBPO95630 424 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 OR4A8P0C604 315 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 G6PDP11413 515 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PRPS1L1P21108 318 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 CLK1P49759 484 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TUBA1BP68363 451 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TUBA4AP68366 448 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 KCNJ10P78508 379 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TGFBR3Q03167 851 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MPP2Q14168 576 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TUBA1AQ71U36 451 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM99Q8N816 258 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-203ENST00000372906 MID2Q9UJV3 735 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms