RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362944.1

RNU6-1260P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1260, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1260P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SFTPBP07988 381 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 C8orf89P0DMQ9 161 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 IL11P20809 199 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 APLNRP35414 380 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CXCL12P48061 93 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PLK1P53350 603 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 GALK2Q01415 458 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 IL1RL1Q01638 556 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 FUT5Q11128 374 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 IFT88Q13099 833 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SPP2Q13103 211 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SLMAPQ14BN4 828 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ATP6AP1Q15904 470 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TIGITQ495A1 244 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SMUG1Q53HV7 270 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 GPRC6AQ5T6X5 926 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 HES5Q5TA89 166 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TIGD3Q6B0B8 471 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 LCN12Q6JVE5 192 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PRMT9Q6P2P2 845 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 GUSBP11Q6P575 273 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TRAT1Q6PIZ9 186 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 HSDL2Q6YN16 418 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 FAM47EQ6ZV65 393 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 BRINP3Q76B58 766 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 P4HA3Q7Z4N8 544 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CCDC83Q8IWF9 413 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SMC5Q8IY18 1101 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 DEFB119Q8N690 84 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 NHLRC2Q8NBF2 726 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 APCDD1LQ8NCL9 501 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 LY6G5BQ8NDX9 201 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 M1APQ8TC57 530 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 FAM110BQ8TC76 370 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TMEM45BQ96B21 275 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CCDC51Q96ER9 411 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 AMDHD1Q96NU7 426 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CITED1Q99966 193 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 HSPB9Q9BQS6 159 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 RHOXF2Q9BQY4 288 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 NAPBQ9H115 298 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SRMSQ9H3Y6 488 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TMEM161AQ9NX61 479 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 NARFQ9UHQ1 456 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CDH7Q9ULB5 785 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PLXNA3P51805 1871 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TTC26A0AVF1 554 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ARHGEF35A5YM69 484 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 C5orf63A6NC05 138 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 BTNL10A8MVZ5 291 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CHEK1O14757 476 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 BUB1O43683 1085 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CRCPO75575 148 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 H6PDO95479 791 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 GNA14O95837 355 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 APCSP02743 223 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CD74P04233 296 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ZNF735P0CB33 412 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 AKR1B1P15121 316 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CASTP20810 708 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TMOD1P28289 359 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SOX6P35712 828 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 HTR5AP47898 357 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PITPNBP48739 271 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SMSP52788 366 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CASP9P55211 416 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 CDH4P55283 916 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 SLC7A9P82251 487 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ERCC8Q13216 396 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PTK6Q13882 451 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 TFDP1Q14186 410 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PARP6Q2NL67 630 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 KCTD11Q693B1 232 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 C11orf71Q6IPW1 123 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 PLBD1Q6P4A8 553 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 LINC00173Q6ZV60 143 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1260P-201ENST00000362944 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms