RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 PON3Q15166 354 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 TRANK1O15050 2925 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 MEIKINA0A087WXM9 373 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 MCIDASD6RGH6 385 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF10CO14798 259 aa16.75■□□□□ 0.27
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SPNS3-201ENST00000355530 CRYZL1O95825 349 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 CA3P07451 260 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 HOXB2P14652 356 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 DIO1P49895 249 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 GPR143P51810 404 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 FAM209AQ5JX71 171 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 SGTBQ96EQ0 304 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 NCDNQ9UBB6 729 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0J9YY10 115 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GTQ1 180 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 GPR171O14626 319 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 RAF1P04049 648 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 GDNFP39905 211 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 LSSP48449 732 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 HSF2Q03933 536 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 IKZF1Q13422 519 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 FGFBP1Q14512 234 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 SLC35D3Q5M8T2 416 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 OR11H4Q8NGC9 324 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQF6 199 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 LEUTXA8MZ59 168 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM127O75204 238 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ITGA10O75578 1167 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A5O76082 557 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 IGKV1D-16P01601 117 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 WNT1P04628 370 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 COL9A1P20849 921 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 UQCRC1P31930 480 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ST3GAL2Q16842 350 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 BMFQ96LC9 184 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 C20orf85Q9H1P6 137 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 LRP4O75096 1905 aa16.74■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 PDCD5O14737 125 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 PPM1BO75688 479 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF141Q15928 474 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 BMPERQ8N8U9 685 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF527Q8NB42 609 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF680Q8NEM1 530 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 RPS4Y2Q8TD47 263 aa16.73■□□□□ 0.27
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SPNS3-201ENST00000355530 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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SPNS3-201ENST00000355530 SSNA1O43805 119 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 PEX14O75381 377 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 RDH16O75452 317 aa16.73■□□□□ 0.27
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SPNS3-201ENST00000355530 PARM1Q6UWI2 310 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 CMTM4Q8IZR5 234 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 FGF14Q92915 247 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 MARVELD3Q96A59 401 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 DERL3Q96Q80 235 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 NOX4Q9NPH5 578 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 POT1Q9NUX5 634 aa16.73■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 AIPO00170 330 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 GNB5O14775 395 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 ARPC3O15145 178 aa16.72■□□□□ 0.27
SPNS3-201ENST00000355530 SELENOFO60613 162 aa16.72■□□□□ 0.27
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