RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PPP2CBP62714 309 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PPP2CAP67775 309 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NKAIN4Q8IVV8 208 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 AGBL5Q8NDL9 886 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR6C1Q96RD1 312 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NUP50Q9UKX7 468 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 IGHG1P01857 330 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 PHC2Q8IXK0 858 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ASB17Q8WXJ9 295 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 STACQ99469 402 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 MEIS3P1A6NDR6 274 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 GNMTQ14749 295 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CDK10Q15131 360 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ADPRMQ3LIE5 342 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 KIAA1211LQ6NV74 962 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 GSG1LQ6UXU4 331 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 RIMKLAQ8IXN7 391 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ZNF611Q8N823 705 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 GHSRQ92847 366 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TTC3P53804 2025 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 F5P12259 2224 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CDHR4A6H8M9 788 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 TEAD1P28347 426 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 SIRPAP78324 504 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 FAM69AQ5T7M9 428 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 CCL4L1Q8NHW4 92 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ZFPM2Q8WW38 1151 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 DEDD2Q8WXF8 326 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 AIFM2Q9BRQ8 373 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 DUSP22Q9NRW4 184 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-201ENST00000345716 ACOD1A6NK06 481 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 BSGP35613 385 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SLC35A2P78381 396 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 ARL14Q8N4G2 192 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 OR5D14Q8NGL3 314 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 CHRDQ9H2X0 955 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 PRDM9Q9NQV7 894 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 GOSR2O14653 212 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 MOKQ9UQ07 419 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 DNAJB6O75190 326 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 DCDP81605 110 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SPOCK1Q08629 439 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 BEND4Q6ZU67 534 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SLC35A4Q96G79 324 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 OR51J1Q9H342 316 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 WASH6PQ9NQA3 447 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 ZNF35P13682 527 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 CFAP77Q6ZQR2 320 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 ZNF385DQ9H6B1 395 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R3Q9NYW6 316 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 COL4A5P29400 1685 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 MCM3APO60318 1980 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 HYAL4Q2M3T9 481 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 AGAP6Q5VW22 663 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 LILRA6Q6PI73 481 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 FCRLAQ7L513 359 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 AGAP4Q96P64 663 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 CDC6Q99741 560 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 GIFP27352 417 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 HTR2BP41595 481 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 AGBL4Q5VU57 503 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SLC35D2Q76EJ3 337 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 PTOV1Q86YD1 416 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 MRGPRX1Q96LB2 322 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 CHST8Q9H2A9 424 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SC5DO75845 299 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 AKAIN1P0CW23 69 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 PRPH2P23942 346 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 OR1D5P58170 312 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 C14orf28Q4W4Y0 310 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 CLDN22Q8N7P3 220 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SDF2Q99470 211 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GTW7 788 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 M0R036 132 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 PRAF2O60831 178 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 GDF1P27539 372 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 SHC1P29353 583 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-201ENST00000345716 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms