RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336057.9

HDAC5-202, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC5, Length 5,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-202ENST00000336057 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RSU1Q15404 277 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 IL21Q9HBE4 155 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SULT1C4O75897 302 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 EVI2BP34910 448 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SFTPDP35247 375 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DCAF7P61962 342 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MEF2DQ14814 521 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TCTN2Q96GX1 697 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 S100A2P29034 98 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 AQP2P41181 271 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 EPHA5P54756 1037 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CLDN12P56749 244 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RAP2BP61225 183 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TSC22D1Q15714 1073 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ARSKQ6UWY0 536 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 A0A1W2PR48 441 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CDC14CA4D256 554 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SLC35E2P0CK97 266 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TAS2R31P59538 309 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TAS2R19P59542 299 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CXADRP78310 365 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 B4GALNT1Q00973 533 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 JMJD7P0C870 316 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR5B2Q96R09 309 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TTC3P53804 2025 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DIRAS3O95661 229 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 EMP2P54851 167 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RHEBQ15382 184 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 VASNQ6EMK4 673 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CRB3Q9BUF7 120 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 FABP7O15540 132 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SEC14L5O43304 696 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TCRBP04435 133 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 9.8
HDAC5-202ENST00000336057 HLA-DMAP28067 261 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DLSTP36957 453 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR6V1Q8N148 313 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 OR14A2Q96R54 314 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RGS19P49795 217 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SPOCK1Q08629 439 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 CDK10Q15131 360 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DUSP6Q16828 381 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 Q499Y3 187 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SLC35B4Q969S0 331 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 NIPAL2Q9H841 368 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 PRRT4C9JH25 899 aa14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DDOSTP39656 456 aa14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DUSP5Q16690 384 aa14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.58□□□□□ -0.07
HDAC5-202ENST00000336057 SLC7A6Q92536 515 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms