RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CLEC14AQ86T13 490 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PDZD3Q86UT5 571 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR7G2Q8NG99 324 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.86□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.86□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 NOX3Q9HBY0 568 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 COQ5Q5HYK3 327 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 A0A0B4J2A0 478 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GGT1P19440 569 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 SELENOWP63302 87 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RING1Q06587 406 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 LTBQ06643 244 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TRIB1Q96RU8 372 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PLSCR3Q9NRY6 295 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BTBD17A6NE02 478 aa9.85□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 ERVFC1P60507 584 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RAB33AQ14088 237 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RNF128Q8TEB7 428 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DTD2Q96FN9 168 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF75AQ96N20 296 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PRR14Q9BWN1 585 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.85□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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