RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 THBS1P07996 1170 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 DPP4P27487 766 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 RPE65Q16518 533 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 OR4E2Q8NGC2 313 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ZPLD1Q8TCW7 415 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SNX33Q8WV41 574 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TEX101Q9BY14 249 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PRSS16Q9NQE7 514 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 HAO2Q9NYQ3 351 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GUH1 482 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SERPINA3P01011 423 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PTH2RP49190 550 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 C2orf68Q2NKX9 166 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 METTL11BQ5VVY1 283 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ZNF425Q6IV72 752 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 OVCH1Q7RTY7 1134 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ZNF614Q8N883 585 aa23.26■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PRR32B1ATL7 298 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ACTC1P68032 377 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ACTA1P68133 377 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TNFRSF17Q02223 184 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PLA2G7Q13093 441 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 CREBZFQ9NS37 354 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 KIF25Q9UIL4 384 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 CA5BQ9Y2D0 317 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 P2RX6O15547 441 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 LPLP06858 475 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 DBIP07108 87 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 NMBP08949 121 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 MELKQ14680 651 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ZMYND11Q15326 602 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 FAM69AQ5T7M9 428 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SLC35F2Q8IXU6 374 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 STPG2Q8N412 459 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 FAM71CQ8NEG0 241 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 LIN7BQ9HAP6 207 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHA1Q9HB21 404 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 DEC1Q9P2X7 70 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 IFITM5A6NNB3 132 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 C4orf47A7E2U8 309 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ADH1CP00326 375 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 CSRP2Q16527 193 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 FAM198BQ6UWH4 519 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ST8SIA4Q92187 359 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 LRRC72A6NJI9 287 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 FAM171A2A8MVW0 826 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 MCRIP1C9JLW8 97 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 KRT33AO76009 404 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ZP3P21754 424 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PPP2CBP62714 309 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 PPP2CAP67775 309 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 HDDC2Q7Z4H3 204 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 COX18Q8N8Q8 333 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 THEM6Q8WUY1 208 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 KLHL9Q9P2J3 617 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 NCDNQ9UBB6 729 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 OR2M5A3KFT3 312 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 GABARAPH6UMI1 98 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 EML2O95834 649 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 P2RX1P51575 399 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 MEIOBQ8N635 442 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SYNPRQ8TBG9 265 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ICAM5Q9UMF0 924 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GWA3 101 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SUSD5O60279 629 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 ADH7P40394 386 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 EPHA4P54764 986 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 FHL5Q5TD97 284 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TMEM52Q8NDY8 209 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 SUSD6Q92537 303 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 HDAC8Q9BY41 377 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 TBX21Q9UL17 535 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP3-201ENST00000321337 FOXJ3Q9UPW0 622 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms