RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 VRK2Q86Y07 508 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 ASB13Q8WXK3 278 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 NOX4Q9NPH5 578 aa6.67□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 POT1Q9NUX5 634 aa6.67□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 FBXO17Q96EF6 278 aa6.66□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.66□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 CHST6Q9GZX3 395 aa6.66□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.66□□□□□ -1.34
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CSDE1-201ENST00000261443 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OR2AT4A6NND4 320 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 COLCA2A8K830 154 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 OGG1O15527 345 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 SELLP14151 372 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 FOLR2P14207 255 aa6.66□□□□□ -1.34
CSDE1-201ENST00000261443 EDNRAP25101 427 aa6.66□□□□□ -1.34
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