RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 BAMBIQ13145 260 aa10.15□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SLC51BQ86UW2 128 aa10.15□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 SLC7A7Q9UM01 511 aa10.15□□□□□ -0.78
URB2-201ENST00000258243 A0A1B0GX78 115 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ZNF749O43361 778 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SYT13Q7L8C5 426 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SHFQ7M4L6 423 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NRMQ8IXM6 262 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MTURNQ8N3F0 131 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 GDPD1Q8N9F7 314 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 OR2M2Q96R28 347 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 OCEL1Q9H607 264 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.15□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MBTPS2O43462 519 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 TAP2Q03519 686 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NT5C3BQ969T7 300 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 INPP5KQ9BT40 448 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 RETP07949 1114 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 GRPRP30550 384 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 KEAP1Q14145 624 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SLC17A1Q14916 467 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NAGSQ8N159 534 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 CPN1P15169 458 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 FASLGP48023 281 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 THBS3P49746 956 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 FGFBP1Q14512 234 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 BAGE3Q86Y29 109 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 BAGE2Q86Y30 109 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 OR4K13Q8NH42 304 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 RHOXF1Q8NHV9 184 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 IER2Q9BTL4 223 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ACPTQ9BZG2 426 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 A0A1W2PPC4 97 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 OR5K3A6NET4 321 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NDUFB2O95178 105 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 TXNDC12O95881 172 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 METTL15P1P0C7V9 234 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SDC1P18827 310 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MSX1P28360 303 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 GPR19Q15760 415 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LSMEM2Q8N112 164 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MAL2Q969L2 176 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ARSGQ96EG1 525 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 KIF25Q9UIL4 384 aa10.14□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 CD8B2A6NJW9 211 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 AIFM1O95831 613 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 PTHP01270 115 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 CD8BP10966 210 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 POU3F4P49335 361 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NDUFA6P56556 154 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 C3P1Q6ZMU1 363 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 USP54Q70EL1 1684 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LYRM1O43325 122 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 ALOX12BO75342 701 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LCATP04180 440 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 PRPH2P23942 346 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 PKLRP30613 574 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 HSD17B7P56937 341 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 RAB31Q13636 194 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 MISPQ8IVT2 679 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 SNAPC3Q92966 411 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 IP6K3Q96PC2 410 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 OR4K3Q96R72 315 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 FGF22Q9HCT0 170 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 LOXL2Q9Y4K0 774 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 JRKO75564 520 aa10.13□□□□□ -0.79
URB2-201ENST00000258243 FUCA1P04066 466 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms